DIVERSIDAD DE HONGOS ASOCIADOS A RAÍCES DE PLANTAS DE CAFÉ
Luis Ramírez Camejo 1,2, María L. Prechi 1,2, Kyria Ávila 1,3, Evangelina López 1,2, Marta Vargas 2, Kristin Saltonstall 2, Luis C. Mejía 1,2
1. Instituto de Investigaciones Científicas y Servicios de Alta Tecnología, 2. Instituto Smithsonian de Investigaciones Tropicales, 3. Universidad de Panamá
Las raíces son un órgano donde se da una alta interacción entre plantas y microorganismos. Un clima variable y microorganismos patógenos propios del café (Coffea spp.) hacen que el rendimiento de este rubro agrícola disminuya; por lo que resulta adecuado mejorar la producción y la resistencia al estrés biótico o abiótico. La diversidad y función de hongos endófitos que viven dentro de raíces del cafeto podría permitir la identificación de especies que ayuden al cafeto a tolerar diferentes tipos de estrés. Sin embargo, dichos estudios han sido poco exploradas. A continuación, presentamos la primera aproximación metagenómica para analizar el microbioma fúngico asociado a raíces de tres variedades del cafeto en plantaciones localizadas en tierras altas de la República de Panamá. Raíces de las variedades Geisha, Catuaí y Typica fueron colectadas en la provincia de Chiriquí (Renacimiento y Boquete) y La Comarca Ngäbe Bugle (Hato Chami). El ADN fúngico fue extraído a partir de raíces de 45 individuos y la región ITS1 secuenciada masivamente con la plataforma MiSeq de Illumina. En este estudio comparamos la diversidad fúngica en raíces de diferentes variedades utilizando diferentes criterios para medir la diversidad y riqueza de especies incluyendo los índices de Bray Curtis, Shannon, Chao y Simpson. Durante la presentación discutiremos las implicaciones de los hongos encontrados para la producción de café.
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